非洲猪瘟病毒抗原检测试纸条

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ASFV非洲猪瘟病毒抗原检测试纸条

广州健仑生物科技有限公司

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1、HUMAnN2
哈佛大学公共卫生学院的Eric Franzosa为宏基因组数据分析开发了HUMAnN2。*代HUMAnN主要是根据宏基因组或者宏转录组数据，分析微生物通路在群体中是否存在。也就是说，给HUMAnN提供微生物群落的DNA或RNA序列，它就会告诉你这个群体能够执行什么样的分子功能。HUMAnN2在HUMAnN的基础上进行了拓展，将微生物与特定活性关联起来。
2、MetaPath
MetaPath也是一个用于宏基因组数据分析的重要工具。该工具由马里兰大学的副教授Mihai Pop开发，可以根据宏基因组数据分析特定群体在不同条件下的代谢变化。举例来说，Pop的研究团队对胖人和瘦人进行微生物组研究，通过MetaPath鉴定了脂肪酸生物合成通路的差异。
3、MEGAN5
MEGAN5也用于MetaGenome ANalyzer，初是在2007年开发出来，用于识别长毛猛犸象骨中DNA测序研究的微生物污染。MEGAN5是发布的*版本，除了可以帮助进行分类分析，也可以快速比较多个数据集，区分宏基因组中基因的功能，此外还提供元数据metadata支持和数据可视化的新途径。
4、Nature Methods
此外，近期Nature Methods杂志发布了一个名为TruSPADES的强大工具，可以大大提升研究者们测序宏基因组的能力。这种算法能将Illumina测序仪生成的300bp短读取，合并成大约1万bp的基因组片段（Synthetic Long Reads）。